接种乙肝疫苗后，体内产生抗乙肝病毒表面抗原的抗体，简称表面抗体（抗－HBs），可以有效防止乙肝病毒的感染，从而可以预防急性和慢性乙型肝炎和乙肝病毒感染所得导致各种慢性肝病，包括肝硬化和肝细胞癌。所以乙肝苗被认为是第一个可用于预防人类癌症的疫苗。
　　 此外，丁型肝炎病毒（HDV）是缺陷型病毒，和乙肝病毒具有共同的表面抗原，只有在乙肝病毒复制的细胞内才能感染和复制，因此接种乙肝疫苗在预防乙肝病毒感染的同时也就预防了丁型肝炎病毒的感染，从而也就预防了丁型肝炎。